果树所在特色香蕉种质基因组研究方面取得新进展
近日,果树所香蕉遗传改良团队与广西大学陈玲玲教授团队合作在Cell旗下期刊Plant Communications(生物学1区top,IF=10.5)在线发表了题为“High-quality reference genome assemblies for two Australimusa bananas provide insights into genetic diversity of the Musaceae family and regulatory mechanisms of superior fiber properties”的研究论文。果树所为论文的第一完成单位,广西大学陈玲玲教授指导的博士研究生周润、王朔和我院易干军研究员指导的博士后詹妮为论文共同第一作者,易干军研究员、果树所盛鸥研究员和广西大学陈玲玲教授为论文的共同通讯作者。
香蕉种质资源的多样性十分丰富,栽培香蕉中存在A、B、S、T基因组类型,前三者主要存在真蕉组(Enmusa,2n=22)的种质中,T基因组起源于澳蕉组(Australimusa,2n=20)的种质。Australimusa代表性物种有纤维用途的Musa textilis(Abaca,麻蕉)和富含类胡萝卜素的栽培类型Fe’i (Musa troglodytarum)。组装高质量的香蕉TT基因组对深入研究芭蕉科植物的进化,解析蕉麻纤维性能形成及类胡萝卜素积累的分子机制等具有重要作用。
该研究论文以2个澳蕉组(Australimusa)种质为材料,构建了高质量的香蕉TT参考基因组,探究了芭蕉科物种的基因组进化和全基因组复制事件,解析转座子和染色体重排在基因组进化中的重要作用,最后基于基因组、比较转录组和生理生化实验分析揭示了Abaca优异纤维性能的遗传调控基础。
本研究得到了国家重点研发计划(2019YFD1000203、2019YFD1000900)、国家香蕉产业技术体系(CARS-31-01)等多个项目的资助。
论文连接:https://www.cell.com/plant-communications/fulltext/S2590-3462(23)00209-2
香蕉基因组结构和进化分析