基因中心与南开大学合作发现带TRS基序突变的新型冠状病毒威胁更大
时间:2022-04-15 11:08 来源:基因中心 【字体:大 中 小】
近日,基因中心联合南开大学在重要期刊《南方医科大学学报》发表题为“带TRS基序突变的新型冠状病毒威胁更大”研究论文。基因中心为第一完成单位,基因中心微生物资源研究室贝锦龙副研究员为论文第一作者。
冠状病毒的高频重组事件与跳跃式转录行为等共享依赖于NSP15酶切作用的分子机制,是导致其反复暴发的主要因素之一。转录调控序列TRS是发挥这一机制的关键顺式作用元件。
贝锦龙副研究员与南开大学高山副教授等采用进化与分子功能联合分析法,对已公开的全部套目病毒基因组数据进行了分析,发现除Beta冠状病毒B亚群外的各类群普遍存在至少一个TRS-B中的经典TRS基序突变为非经典基序的现象。并推断:TRS基序突变导致相关类群基因转录能力与NSP15调控能力降低,并使病毒减毒后失去了跨物种传播与大爆发能力;B、C和E亚群仍然处于活跃期,将长期威胁人类健康;不带TRS基序突变的Beta属B亚群,则是迄今毒力最强的一个分支;包括Omicron在内的各种新冠突变株只有通过TRS基序突变,才能变成失去跨物种传播与大爆发能力超级减毒株;但如果多种超级减毒株长期共存,会形成一个庞大的基因库,可与其它非减毒株进行重组产生各种新毒株,潜在威胁反而更大。本研究也为“疫情防控工作不能松懈”提供了部分理论依据。
本研究得到广东省自然科学基金(2021A1515011072)和农业农村部广东华南省现代种业产业重点实验室、广东省农作物种质资源保存与利用重点实验室等项目资助。