近日，果树所联合北京大学现代农业研究院等多家单位合作撰写题为“Genomic insights into longan evolution from a chromosome-level genome assembly and population genomics of longan accessions”的研究论文在《Horticulture Research》（中科院大类一区，IF=6.793）在线发表。果树所王静博士和李建光研究员为论文共同第一作者，北京大学现代农业研究院郭立研究员和中国农业科学院深圳农业基因组研究所钱万强研究员、果树所李建光研究员为共同通讯作者。

　　该论文结合单分子测序技术和染色体构象捕获技术，完成了龙眼栽培品种“鸡蛋本”的基因组序列破译工作，获得了染色体级别的龙眼参考基因组。本次发布的龙眼基因组序列大小为455.5Mb，Contig N50达到了12.1 Mb，BUSCO分析结果显示基因组完整性为98.1%。Hi-C辅助组装技术组装到染色体水平基因组（图1a）。基因家族鉴定及分析结果表明，龙眼中的苯丙烷类生物合成相关基因家族数量扩增。

龙眼的基因组学和种群结构分析

　　通过对87个龙眼种质基因组遗传变异分析，发现龙眼群体表现出明显的地理结构，揭示了不同地理起源品种间明显的群体混合和渗入现象，推测龙眼可能的迁徙轨迹。利用高质量基因组和丰富的遗传材料，研究人员进行了GWAS分析，鉴定了6个与果实品质显著相关的数量性状基因座（QTL），发现了3个潜在控制可溶性固形物和种子重量的QTLs位点。高质量的基因组组装、注释和进化分析对龙眼的功能基因组研究和分子育种具有重要价值，为提高龙眼产量、果实品质和开发龙眼的药用价值奠定了坚实的分子理论基础。

GWAS关联分析龙眼种子大小与果实可溶性固形物含量性状