环艺所在姜亚科的分子进化研究方面取得新进展
近日,环艺所特色花卉研究室在姜亚科的分子进化研究方面取得新进展,并在期刊《BMC Plant Biology》(JCR二区,IF4.215 )在线发表了Molecular evolution of chloroplast genomes in subfamily Zingiberoideae (Zingiberaceae)的研究论文。环艺所李冬梅副研究员为第一作者,环艺所朱根发研究员为通讯作者。
论文链接(https://doi.org/10.1186/s12870-021-03315-9)。
姜科植物(Zingiberaceae)有1200多种,分布53个属,遍布热带和亚热带地区,物种多样性集中在南亚和东南亚。姜亚科(Zingiberoideae)中的4个属都有50种以上的植物,包括舞花姜属(Globba,100种), 姜花属(Hedychium,> 80种),山奈属(Kaempferia,50种)和姜属(Zingiber,150种)。尽管姜亚科的这些物种在农业、医药和园艺方面具有重要意义,但它们的基因组资源和合适的分子标记目前很少。在过去20年里,姜亚科中的舞花姜属、姜花属、山柰属和姜属四个属之间的系统发育关系模糊。在本研究中,基于叶绿体基因组来源的单核苷酸多态性数据的系统发育树有力地证明了舞花姜属,姜花属,姜黄属I+山奈类(包括姜黄属II、山柰属和姜属)在姜亚科中显示出高分辨率的嵌套进化关系。基于分子系统发育结果,建议舞花姜被转移到姜族。同时,对18个姜亚科植物的叶绿体基因组的比较基因组学分析产生了12个高度可变区,这些变异区可用作系统发育分析和物种鉴定的潜在分子标记来源。此外,在氨基酸位点水平上,14个基因正选择,可能在姜亚科物种进化和适应不同环境中发挥重要作用。这些结果增加了姜亚科可用的基因组资源,对今后的进化和系统发育研究将是有用的。
本研究得到广东省基础与应用基础基金项目(No. 2021A1515010893),创意农业研究团队项目(No. 202128TD),广东省重点领域研发项目(No. 2020B02022007)和市院合作项目(2019)等资助。