环境园艺所国兰研究取得突破性进展
国兰是兰科(Orchidaceae)兰属(Cymbidium)地生型小花种植物的统称,在中国有几千年的栽培历史,享有“王者之香”“百草之长”的美誉。墨兰(Cymbidium sinense)又称报岁兰,备受我国和受我国文化影响的亚洲国家人们的喜爱。南宋末期越时庚《金漳兰谱》中描述墨兰:“色深紫,有十五萼,干紫英红,色映人目,如翔鸾翥凤,千态万状;叶则高大刚毅劲节,苍然可爱。”因其丰富的瓣型、叶色以及香气特征使得其成为研究兰科植物进化的理想材料。
近日,环境园艺研究所在国际著名期刊《Plant Biotechnology Journal》 (Q1/IF:9.803)上发表了题为“The genome of Cymbidium sinense revealed the evolution of orchid traits”的最新研究成果。环艺所杨凤玺研究员为第一作者, 高洁、魏永路助理研究员为共同第一作者,环艺所朱根发研究员、福建农林大学刘仲建教授以及台湾成功大学蔡文杰教授为通讯作者。
该研究采用Nanopore 长片段测序结合 Illumina HiSeq 4000二代测序数据校正以及Hic建库测序染色体挂载等技术对墨兰基因组进行测序分析,首次获得了我国传统国兰的基因组,也是迄今为止发表的兰科植物属种中最大的基因组。组装的参考基因组大小为3.52 Gb,染色体挂载率97.79%,注释获得29,638个蛋白质编码基因。同时,本研究基于高质量的墨兰基因组序列结合系统的比较基因组学研究手段,对墨兰的花型、花期、花色、花香以及叶色等5个重要观赏形状的进化以及分子调控机制进行了着重阐述,分析结果将为国兰功能基因的育种应用和性状定向改良奠定良好基础。
该项研究依托广东省自然科学基金团队项目(2017A030312004)、国家重点研发专项((2018YFD1000400, 2019YFD1001003)、广东省科技计划项目(2019B030316033)、广州市重点研发项目 (201707010307), 以及广东省现代农业产业创新体系(2021KJ121), 和省农科院学科团队建设(202127 TD)等项目资助。
“十三五”以来,环境园艺所国兰研究团队深入围绕国兰育种应用基础研究的关键问题,在国兰核心种质资源库建立、重要性状功能基因挖掘、分子标记开发和新品种选育、种苗繁育、花期精准调控等方面,承担了包括国家自然科学基金、国家重点研发专项子课题、广东省现代种业重点研发专项等在内20余个项目,发表JCR二区或IF3 以上的SCI论文10篇,选育国兰新品种6个,获国家授权发明专利5项, 软件著作权13项,显著提升我院兰花学科在国内以及国际上的学术影响力。