动卫所联合华南农业大学等单位在猪德尔塔冠状病毒遗传演化方面取得新进展
时间：2022-04-01 17:48
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猪德尔塔冠状病毒（PDCoV），又名猪丁型冠状病毒，是具有包膜的单股正链RNA病毒，与新冠肺炎病毒（SARS-CoV-2）同属于冠状病毒科，是已知RNA病毒中基因组最大的一类病毒。PDCoV于2012年首次在香港猪群中被发现。2014年在美国各大猪场暴发该病，并随后流行于世界各地，包括我国（图1）。之后，多篇动物试验研究证实PDCoV可感染鸡、火鸡、犊牛等，并表现出轻度腹泻症状。2021年，Nature杂志还发表了PDCoV感染海地儿童的论文。在新冠肺炎大流行期间，人类高度关注包括PDCoV在内的动物冠状病毒跨物种传播。
论文网址：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/tbed.14503
图1 PDCoV在世界的流行分布
近日，题为“Phylogeography and evolutionary dynamics analysis of porcine delta-coronavirus with host expansion to humans”的研究论文在兽医权威期刊《Transboundary and Emerging Diseases》（Top一区期刊）在线发表。遗传进化分析表明本研究分离的和已知的所有PDCoV毒株可分为中国谱系、美国谱系和东南亚等三大谱系（图2）；重建的PDCoV全球空间扩散网络研究显示PDCoV起源于1996年左右的亚洲，2007年左右传播到美国，然后蔓延到东亚和南美洲，海地人感染的PDCoV最有可能源自美国（图3、图4）。
图2 PDCoV遗传进化分析
图3 PDCoV全基因组的历史演化分析
图4 PDCoV 空间扩散
图 5论文在线截图
华南农业大学兽医学院2021级博士研究生李根、广东省农业科学院动物卫生研究所翟少伦研究员、华南农业大学兽医学院已毕业博士研究生/我院拟进站博士后周霞博士为论文共同第一作者，华南农业大学兽医学院贺东生教授和陈瑞爱教授为共同通讯作者。该论文获得了广东省生猪产业体系创新团队、广东省重点研发计划、广东省岭南现代农业科技实验室肇庆分中心重点项目、广东省农业科学院人才培养项目等的资助。论文网址：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/tbed.14503