近日，果树所优稀水果研究团队在国际学术期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry（中科院一区，IF=5.7）发表题为“Identification of Key Genes Controlling Sugar and Organic Acid Accumulation in Wampee Fruit (Clausena lansium) via Genome Assembly and Genome-wide Association Analysis”的研究论文。果树所为论文第一单位，果树所陈慧琼博士为该论文第一作者，果树所陆育生研究员和北京大学现代农业研究院郭立研究员为论文共同通讯作者，团队成员参与了相关工作。

      我国是世界黄皮遗传资源最多、栽培面积最广和产量最高的国家。黄皮果实营养丰富，具有抗氧化、防衰老、抑肿瘤等功效，是少有的药食兼用型水果，深受消费者的喜爱。果实风味是决定果树品种的大众接受度的关键因素，而果实糖酸含量是影响果实风味的主要因素。

      本研究首先利用三代测序技术和Hi-C组装技术对金丰黄皮基因组进行组装，得到染色体水平的黄皮参考基因组，其大小为284.15 Mb，在Hi-C测序的辅助下，93.83%的组装序列被锚定到9条假染色体上，contig总长297.1 Mb，scaffold总长为297.1 Mb。本研究接着对266份黄皮核心种质进行重测序，通过选择印迹分析与全基因关联分析发掘到调控黄皮果实糖酸的关键转录因子ClERF061和糖转运蛋白基因ClSWEET7，ClERF061和ClSWEET7表达水平和果实糖酸积累显著相关，并初步验证ClERF061具有激活下游靶基因ClSWEET7启动子的功能，推测它们可能共同参与了黄皮果实糖酸积累的调控。本研究有助于深入了解黄皮果实糖酸品质形成的生理与分子机制，为培育适当糖酸比例、风味好的黄皮品种提供理论依据和基因资源。

      该研究得到了广东省乡村振兴战略专项（2024-NPY-00-032；2023-NBH-00-004），广东省农业科学院优博项目（R2021YJ-YB3022），广东省现代农业产业技术体系创新团队（2022KJ116,2023KJ116），广州市科技计划项目（2023A04J0141）等项目的资助。

      原文链接：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jafc.4c04830

选择印迹分析与全基因关联分析发掘调控黄皮果实糖酸的关键基因