微生物资源研究室主要开展农业微生物特色菌种资源挖掘及其利用研究，新技术、新产品开发与推广应用。开展动物肠道微生物、食用微生物等农业微生物的研究。
       主要研究领域：
       不同农业微生物特色菌种资源的收集、整理、鉴定与保藏；农业微生物菌种资源功能挖掘与评价及其作用机理研究；优势微生物菌种的遗传改造；优势农业微生物菌种资源高效利用新技术新产品开发及其应用推广；利用微生物对工农业废弃进行资源化利用开发。